RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 THAP9Q9H5L6 903 aa31.5■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 PRPHP41219 470 aa31.49■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 MAD2L2Q9UI95 211 aa31.49■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 IRS2Q9Y4H2 1338 aa31.49■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP25P42331 645 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 IRF2BP1Q8IU81 584 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 AMOTL1Q8IY63 956 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 STAG2Q8N3U4 1231 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 RAB21Q9UL25 225 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA6Q9UN73 950 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.48■■■□□ 2.63
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UBP1-201ENST00000283628 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 ADRA2BP18089 450 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 USP5P45974 858 aa31.48■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 LONRF2Q1L5Z9 754 aa31.48■■■□□ 2.63
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UBP1-201ENST00000283628 CDC25AP30304 524 aa31.47■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 UBA7P41226 1012 aa31.47■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 MB21D1Q8N884 522 aa31.47■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa31.47■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 KBTBD4Q9NVX7 518 aa31.47■■■□□ 2.63
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UBP1-201ENST00000283628 RASSF8Q8NHQ8 419 aa31.47■■■□□ 2.63
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UBP1-201ENST00000283628 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa31.47■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.46■■■□□ 2.63
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UBP1-201ENST00000283628 TYW1BQ6NUM6 668 aa31.46■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 OR8K1Q8NGG5 319 aa31.46■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 WDR66Q8TBY9 1149 aa31.46■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 RASGRP4Q8TDF6 673 aa31.46■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa31.46■■■□□ 2.63
UBP1-201ENST00000283628 MKNK2Q9HBH9 465 aa31.46■■■□□ 2.63
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UBP1-201ENST00000283628 TUBBP07437 444 aa31.45■■■□□ 2.62
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF507Q8TCN5 953 aa31.44■■■□□ 2.62
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UBP1-201ENST00000283628 TSPY8P0CW00 308 aa31.44■■■□□ 2.62
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UBP1-201ENST00000283628 CTAGE4Q8IX94 777 aa31.42■■■□□ 2.62
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UBP1-201ENST00000283628 SLC27A3Q5K4L6 730 aa31.41■■■□□ 2.62
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UBP1-201ENST00000283628 ABL1P00519 1130 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 PMS1P54277 932 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 AMPD2Q01433 879 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 SLC35G1Q2M3R5 365 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 TTI2Q6NXR4 508 aa31.4■■■□□ 2.62
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