RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 NDUFA8P51970 172 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 FUKQ8N0W3 1084 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TM4SF1P30408 202 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GVL5 298 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SNX1Q13596 522 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 NYXQ9GZU5 481 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SLC35F6Q8N357 371 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 C3orf20Q8ND61 904 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 DOCK2Q92608 1830 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GUL6 1792 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SERPINB2P05120 415 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TRIM74Q86UV6 250 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TRIM73Q86UV7 250 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 CNBD1Q8NA66 436 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.45■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 E2F5Q15329 346 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 NAA35Q5VZE5 725 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SCLT1Q96NL6 688 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 RPSAP08865 295 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MTF1Q14872 753 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PANX2Q96RD6 677 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 OPA1O60313 960 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CTDNEP1O95476 244 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MMP10P09238 476 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CCDC114Q96M63 670 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 ENO4A6NNW6 628 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 AHCYL1O43865 530 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 GYG1P46976 350 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 AMPD2Q01433 879 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 EPN3Q9H201 632 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF213O14771 459 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 FESP07332 822 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 ANTXR2P58335 489 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PTPN21Q16825 1174 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PPFIA2O75334 1257 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PPFIA3O75145 1194 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PSMD1Q99460 953 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K12Q12852 859 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PDCLQ13371 301 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 AIDAQ96BJ3 306 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MBD4O95243 580 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SLMAPQ14BN4 828 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 ARMT1Q9H993 441 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms