RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM94Q12767 1356 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 GPBP1Q86WP2 473 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 VPS52Q8N1B4 723 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 ATP8B3O60423 1300 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 ODR4Q5SWX8 454 aa9.94□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 DCUN1D2Q6PH85 259 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 AMNQ9BXJ7 453 aa9.94□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 MTX1Q13505 466 aa9.93□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF233A6NK53 670 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 SEC24BO95487 1268 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 AP3B2Q13367 1082 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.93□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 HHATQ5VTY9 493 aa9.93□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 TMOD1P28289 359 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 GJC1P36383 396 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 ASPHQ12797 758 aa9.93□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 ACCSQ96QU6 501 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 ABCA6Q8N139 1617 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 COPB2P35606 906 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 RUBCNQ92622 972 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.92□□□□□ -0.82
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