RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.17■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.17■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 PRO3102Q9H379 93 aa26.17■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ACAD9Q9H845 621 aa26.17■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 KDM4AO75164 1064 aa26.16■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC96Q2M329 555 aa26.16■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.16■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.16■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 MTMR7Q9Y216 660 aa26.16■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 B4E1Z4 1266 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 SLC4A3P48751 1232 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF543Q08ER8 600 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 IQCA1Q86XH1 822 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 RNF146Q9NTX7 359 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.15■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 SGSM2O43147 1006 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ICAM1P05362 532 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 FAM133AQ8N9E0 248 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ARRDC4Q8NCT1 418 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 KRT23Q9C075 422 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.14■■□□□ 1.78
PRADC1-201ENST00000258083 SLC16A2P36021 539 aa26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 SNAP25P60880 206 aa26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ANO1Q5XXA6 986 aa26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC174Q6PII3 467 aa26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 PTH1RQ03431 593 aa26.12■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.12■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.12■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.12■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 LAMA3Q16787 3333 aa26.12■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ALAS1P13196 640 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 AKR1A1P14550 325 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 PNMA1Q8ND90 353 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.11■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CYP21A2P08686 494 aa26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 RARBP10826 455 aa26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC41Q15345 812 aa26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 TNKSO95271 1327 aa26.1■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 POTEB2H3BUK9 544 aa26.09■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CNTN2Q02246 1040 aa26.09■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 KATNBL1Q9H079 304 aa26.09■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 CYP39A1Q9NYL5 469 aa26.09■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 SOWAHBA6NEL2 793 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ARMCX2Q7L311 632 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 MAP4K1Q92918 833 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 PNMA2Q9UL42 364 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 ASTN1O14525 1302 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.08■■□□□ 1.77
PRADC1-201ENST00000258083 KBTBD13C9JR72 458 aa26.07■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 ADAMTS4O75173 837 aa26.07■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 ACVR2BQ13705 512 aa26.07■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 SEC23AQ15436 765 aa26.07■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.07■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 KAT14Q9H8E8 782 aa26.07■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.06■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 GDF15Q99988 308 aa26.06■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.06■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.06■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 SZT2Q5T011 3432 aa26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 SNX17Q15036 470 aa26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 PHF24Q9UPV7 400 aa26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.05■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 PGK1P00558 417 aa26.04■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.04■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.04■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 RNF180Q86T96 592 aa26.04■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 A0A1W2PPC1 479 aa26.03■■□□□ 1.76
PRADC1-201ENST00000258083 ASB14A6NK59 587 aa26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms