RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225648.3

HOXB6-201, Transcript of homeobox B6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB6, Length 1,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6-201ENST00000225648 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 IL17RAQ96F46 866 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 MGAMO43451 1857 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB6-201ENST00000225648 COPB2P35606 906 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB6-201ENST00000225648 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB6-201ENST00000225648 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB6-201ENST00000225648 CYP2B6P20813 491 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SLC4A3P48751 1232 aa22.14■■□□□ 1.14
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HOXB6-201ENST00000225648 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 ADCY3O60266 1144 aa22.14■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 FCER1AP12319 257 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 RXRAP19793 462 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 ADORA2AP29274 412 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 COBLO75128 1261 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 ELNP15502 786 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 MTMR8Q96EF0 704 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 CALM2P0DP24 149 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 CALM3P0DP25 149 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 RGS2P41220 211 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 BRF1Q92994 677 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 MMP19Q99542 508 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 FBXO40Q9UH90 709 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 PLXNB2O15031 1838 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 BRCA2P51587 3418 aa22.11■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 FGD1P98174 961 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 KCTD2Q14681 263 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 CCL14Q16627 93 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 MICU3Q86XE3 530 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 TRIB2Q92519 343 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 ZNF333Q96JL9 665 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 APBA2Q99767 749 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 RNF146Q9NTX7 359 aa22.11■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 EVCP57679 992 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 ACAD9Q9H845 621 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXB6-201ENST00000225648 SMARCA1P28370 1054 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 PNMA2Q9UL42 364 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB6-201ENST00000225648 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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