RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXD10P28358 340 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC174Q6PII3 467 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CALM1P0DP23 149 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CALM2P0DP24 149 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CALM3P0DP25 149 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 APOBRQ0VD83 1088 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF11Q86T75 865 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 ICAM1P05362 532 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF5BP33176 963 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 FLT3LGP49771 235 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A39-201ENST00000225308 CYTH3O43739 400 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 COPB2P35606 906 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 PRMT2P55345 433 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 MORN1Q5T089 497 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 FANCBQ8NB91 859 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB43O43298 467 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPREP23469 700 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC4A3P48751 1232 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RCAN1P53805 252 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 GRB14Q14449 540 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 USP6NLQ92738 828 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR8Q96EF0 704 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 BACH2Q9BYV9 841 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 EVCP57679 992 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF2CQ99661 725 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 STRNO43815 780 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 ALAS1P13196 640 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 IRF5Q13568 498 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 NID2Q14112 1375 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 FCER1AP12319 257 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 ADORA2AP29274 412 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 CHST13Q8NET6 341 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RAET1EQ8TD07 263 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF146Q9NTX7 359 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 GNAQP50148 359 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP2K5Q13163 448 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RTN1Q16799 776 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCA1P28370 1054 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 TKFCQ3LXA3 575 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PIGSQ96S52 555 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ACAD9Q9H845 621 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO40Q9UH90 709 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 LCTP09848 1927 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB5O15062 677 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXC6P09630 235 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP2B6P20813 491 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC27P30260 824 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.631e-7■■■□□ 14.6
SLC25A39-201ENST00000225308 KCTD2Q14681 263 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 HOMER1Q86YM7 354 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 MMP19Q99542 508 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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