RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 TMEM87BQ96K49 555 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 BUB1O43683 1085 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ANXA1P04083 346 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 JRKLQ9Y4A0 524 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 POTEB3A0JP26 581 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 SGK1O00141 431 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 POTEBQ6S5H4 581 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 HACE1Q8IYU2 909 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ADAMTS2O95450 1211 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 KAZNQ674X7 775 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 MAFGO15525 162 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 MBD4O95243 580 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 BFSP1Q12934 665 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ZNF449Q6P9G9 518 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 NLRC4Q9NPP4 1024 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 KSR2Q6VAB6 950 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 GDAP1Q8TB36 358 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ING2Q9H160 280 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 SBNO1A3KN83 1393 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 A6NJR5 290 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 B4E1Z4 1266 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 CPP00450 1065 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 TMED2Q15363 201 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 TEX12Q9BXU0 123 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 SLC27A2O14975 620 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 HLA-DPA1P20036 260 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 NLRP3Q96P20 1036 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 BLZF1Q9H2G9 400 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-201ENST00000171887 MYH15Q9Y2K3 1946 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 KLC3Q6P597 504 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 SPAG7O75391 227 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 AOX1Q06278 1338 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 KDRP35968 1356 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 TCP1P17987 556 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 E2F4Q16254 413 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 RNF217Q8TC41 542 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 JAG2Q9Y219 1238 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 DACH2Q96NX9 599 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 TADA3O75528 432 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 GUCY2CP25092 1073 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 EPHB4P54760 987 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 CEP85Q6P2H3 762 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 ATP6V1E2Q96A05 226 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 ARHGEF11O15085 1522 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 TOM1L1O75674 476 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 NELFCDQ8IXH7 590 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 IGF1RP08069 1367 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 PIK3CAP42336 1068 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 ARHGDIAP52565 204 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 RNF207Q6ZRF8 634 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 GPBP1Q86WP2 473 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 MCUQ8NE86 351 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.08□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 USH1GQ495M9 461 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 KDM1AO60341 852 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 CPA1P15085 419 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 NSFP46459 744 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 EHHADHQ08426 723 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 LRWD1Q9UFC0 647 aa10.07□□□□□ -0.8
TNS1-201ENST00000171887 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms