RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam170aQ66LM6 333 aa22.62■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Nup133Q8R0G9 1155 aa22.62■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.62■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf287Q9EQB9 759 aa22.62■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa22.61■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Cst8P32766 142 aa22.61■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pla2g6P97819 807 aa22.61■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 DmwdQ08274 665 aa22.61■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa22.61■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Otop3Q80UF9 577 aa22.61■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Crb2Q80YA8 1282 aa22.61■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gmcl1Q920G9 524 aa22.61■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif26aQ52KG5 1881 aa22.6■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Map4k1P70218 827 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stxbp3Q60770 592 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trim27Q62158 513 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp943Q6NZP4 507 aa22.6■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Snx29Q9D3S3 818 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 PolkQ9QUG2 852 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sept3Q9Z1S5 350 aa22.6■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 TrioQ0KL02 3102 aa22.59■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 G430095P16RikE9Q913 147 aa22.59■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 PtprcapQ64697 197 aa22.59■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc12Q8BW49 704 aa22.59■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sall2Q9QX96 1004 aa22.59■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa22.59■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa22.58■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snap25P60879 206 aa22.58■■□□□ 1.21
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Sap30bpQ02614 308 aa22.58■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atg4aQ8C9S8 396 aa22.58■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtmr14Q8VEL2 648 aa22.58■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arid3bQ9Z1N7 568 aa22.58■■□□□ 1.21
Ltb-201ENSMUST00000025262 RabggtbP53612 339 aa22.57■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Xkr5Q5GH66 676 aa22.57■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Zscan18E9PUD6 809 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Eepd1Q3TGW2 569 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grxcr1Q50H32 290 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tspyl2Q7TQI8 677 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dis3lQ8C0S1 1053 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Clip2Q9Z0H8 1047 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 PatjQ63ZW7 1834 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col5a3Q9JLI2 1739 aa22.56■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm15448F6PZL4 682 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf19aP50636 840 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kctd1Q5M956 257 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Etaa1Q5SVT3 877 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Elf1Q60775 612 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem151bQ68FE7 561 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgef6Q8K4I3 771 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Necab2Q91ZP9 389 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgef25Q9CWR0 618 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Baz2bA2AUY4 2123 aa22.55■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc1a4O35874 532 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 NapbP28663 298 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ftl1P29391 183 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Riox2Q8CD15 465 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zcchc18Q8VD24 393 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 MutyhQ99P21 515 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 FanclQ9CR14 375 aa22.54■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 DgkhD3YXJ0 1156 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Jakmip2D3YXK0 820 aa22.53■■□□□ 1.2
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Il13ra2O88786 383 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trappc3lQ4KL14 181 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wnt8aQ64527 354 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tcaf3Q6QR59 914 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxo10Q7TQF2 950 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 BC048507Q80ZS7 89 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Defb36Q8K3U4 67 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa22.53■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lnx1O70263 728 aa22.52■■□□□ 1.2
Ltb-201ENSMUST00000025262 GaaP70699 953 aa22.52■■□□□ 1.2
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