RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	YIL001W	P40560	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NCS6	P53088	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	FMN1	Q03778	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ADY3	Q07732	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ESC8	Q08119	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	APC9	Q12107	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	EXO70	P19658	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SPS22	P25380	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RAD14	P28519	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	URA10	P30402	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SIN4	P32259	974 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DGR2	P32330	852 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DAL3	P32459	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MRPL7	P36519	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ECM29	P38737	1868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RIM4	P38741	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
TRS33	YOR115C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	STL1	P39932	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ERR3	P42222	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SKP2	P42843	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	LAM5	P43560	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	POL31	P46957	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RFX1	P48743	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SLT2	Q00772	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ACL4	Q03771	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CDA1	Q06702	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TPO1	Q07824	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	THI20	Q08224	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	OCA6	Q12454	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
TRS33	YOR115C	GAL1	P04385	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GPA2	P10823	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	KAR1	P11927	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CLB4	P24871	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YME2	P32843	850 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NUP120	P35729	1037 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RIM2	P38127	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	BIT2	P38346	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ALG5	P40350	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MND2	P40577	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YFL040W	P43562	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	BNA2	P47125	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MRM2	P53123	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	COS6	P53344	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YPR003C	P53394	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MUK1	Q02866	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SKY1	Q03656	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TVP15	Q03860	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YET2	Q04210	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RSB1	Q08417	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DIF1	O13577	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ENA1	P13587	1091 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	VPS34	P22543	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YCL068C	P25593	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PTP2	P29461	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GDA1	P32621	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DRE2	P36152	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TSC10	P38342	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PPE1	P38796	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	AIM18	P38884	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YAT2	P40017	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	JEM1	P40358	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ATM1	P40416	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	IML2	P47031	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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