RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	RPR2	P40571	144 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	PEX8	P53248	589 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	ARP6	Q12509	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	RRT2	P38332	387 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	PKP1	P40530	394 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	COG1	P53079	417 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	PCD1	Q12524	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TYR1	P20049	452 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	NDC1	P32500	655 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	SMC3	P47037	1230 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	YGL242C	P53066	181 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	ATG9	Q12142	997 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	UBA4	P38820	440 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	YTA12	P40341	825 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	CDC45	Q08032	650 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	SNF3	P10870	884 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	PGS1	P25578	521 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YBP1	P38315	674 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	APL4	Q12028	832 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	TPK1	P06244	397 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	SPC110	P32380	944 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	PTR2	P32901	601 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	NPR3	P38742	1146 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YGL082W	P53155	381 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	CDC15	P27636	974 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	PTP2	P29461	750 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	MRPL36	P36531	177 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	ANS1	P38832	159 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	PSF2	P40359	213 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YNR061C	P53747	219 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	SAM50	P53969	484 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	DIC1	Q06143	298 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	AYT1	Q12226	474 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	SEC62	P21825	274 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	SNC1	P31109	117 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	ECM15	P35195	104 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	SSK1	Q07084	712 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	THI20	Q08224	551 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	VPS17	P32913	551 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YKL050C	P35736	922 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	IDP2	P41939	412 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	GRC3	Q07845	632 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	VCX1	Q99385	411 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	YCL049C	P25577	312 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	INP53	Q12271	1107 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CSI1	YMR025W	HEM2	P05373	342 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	ROT2	P38138	954 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YHL041W	P38730	149 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	ZDS2	P54786	942 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	REG1	Q00816	1014 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	SPE2	P21182	396 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	ERG8	P24521	451 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	SLX1	P38324	304 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	MTC6	P38849	526 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	NUC1	P08466	329 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YEL045C	P32616	141 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	IFA38	P38286	347 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	LAG1	P38703	411 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	UIP3	P39547	235 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	VPS52	P39904	641 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PSK2	Q08217	1101 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83

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