RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	REH1	Q06709	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RUP1	Q12242	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CDC42	P19073	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	AAD3	P25612	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PPG1	P32838	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SEC66	P33754	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NUP120	P35729	1037 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ETR1	P38071	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MRX3	P38172	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YBL028C	P38202	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ERC1	P38767	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TMN3	P40071	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	GYP8	P43570	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CPR7	P47103	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NMA2	P53204	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	FHN1	P53279	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SOL4	P53315	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	BIO4	P53630	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SLT2	Q00772	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ATG17	Q06410	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RAD14	P28519	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RAD16	P31244	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	KAR9	P32526	644 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PHO11	P35842	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PHO12	P38693	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TRM5	P38793	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NUP60	P39705	539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	STL1	P39932	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	AIM20	P40451	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TMA108	P40462	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MAM33	P40513	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SAD1	P43589	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	HLJ1	P48353	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	LIF1	P53150	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NSE1	Q07913	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MET7	Q08645	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	DGR2	P32330	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YKR015C	P36111	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	BET3	P36149	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SRL3	P36167	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CTP1	P38152	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FRT2	P39734	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FTR1	P40088	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	MRM2	P53123	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YGR016W	P53209	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RCF2	P53721	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ASI1	P54074	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	BCP1	Q06338	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YET3	Q07451	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CRD1	Q07560	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	GIS3	Q12418	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	AVL9	Q12500	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
TVP38	YKR088C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	MEF1	P25039	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SNT1	P25357	1226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	COT1	P32798	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	GYP6	P32806	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RIM2	P38127	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
TVP38	YKR088C	YDR089W	P38966	869 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CHS6	P40955	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ALY2	P47029	1046 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.3 ms