RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	YIH1	P25637	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	IAH1	P41734	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	RDR1	Q08904	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	ATG9	Q12142	997 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFA2	YKR062W	SEM1	O94742	89 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	SAN1	P22470	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	MNN2	P38069	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ICS2	P38284	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	FAR3	P46671	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ARP9	Q05123	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RCN2	Q12044	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	AAC3	P18238	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YCK1	P23291	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	POL4	P25615	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	PEP3	P27801	918 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	GAC1	P28006	793 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ELO1	P39540	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	PCL6	P40038	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	SAD1	P43589	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	IRC8	P47046	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	VPS72	Q03388	795 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	MLH2	Q07980	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	PDR3	P33200	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	REG2	P38232	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ANS1	P38832	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	SGM1	P47166	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	VID30	P53076	958 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	TEN1	Q07921	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	BUD7	Q08754	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	IMG1	P25626	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YPK3	P38070	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RKM3	P38222	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	TSC10	P38342	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YIL169C	P40442	995 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RMD8	P43620	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YGL082W	P53155	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	DUG3	P53871	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	NUP53	Q03790	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	GRC3	Q07845	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	BOS1	P25385	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YKL100C	P34248	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ROT2	P38138	954 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	BET4	Q00618	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	MAK10	Q02197	733 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	CDC45	Q08032	650 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	FLC2	P39719	783 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YIL060W	P40519	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	LCL3	P53153	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	ESBP6	P53918	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RSM23	Q01163	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	EKI1	Q03764	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	RSF1	Q05043	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	GRS2	Q06817	618 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	SSK1	Q07084	712 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFA2	YKR062W	GCN4	P03069	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	SNF3	P10870	884 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	GID7	P25569	745 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	MGR1	P25573	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	PGS1	P25578	521 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	TRS65	P32893	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	SEF1	P34228	1148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFA2	YKR062W	UBP11	P36026	717 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms