RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YEH1	Q07804	573 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YPT6	Q99260	215 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	PEP3	P27801	918 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TSC10	P38342	320 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ANS1	P38832	159 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	AFG3	P39925	761 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SPO22	P40511	975 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RMD8	P43620	662 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SMC3	P47037	1230 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SGM1	P47166	707 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	UBP8	P50102	471 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YNL144C	P53907	740 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	EFM6	P53970	246 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	VTC3	Q02725	835 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	CAC2	Q04199	468 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TAH18	Q12181	623 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SGS1	P35187	1447 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	MDM10	P18409	493 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	MIA40	P36046	403 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	REG2	P38232	338 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	FLO5	P38894	1075 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YEL057C	P39983	233 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	IRC8	P47046	822 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SRB7	P47822	140 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YPT11	P48559	417 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	MRPL19	P53875	158 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	GRC3	Q07845	632 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TEN1	Q07921	160 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	APL4	Q12028	832 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	MRP13	P12686	339 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	OCA4	P25366	362 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	NUP133	P36161	1157 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	HXT9	P40885	567 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	GAT1	P43574	510 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SGF73	P53165	657 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	STP1	Q00947	519 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TAF11	Q04226	346 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SPE2	P21182	396 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	IMG1	P25626	169 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	JNM1	P36224	373 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	LEU5	P38702	357 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	DBP8	P38719	431 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YIL060W	P40519	144 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YML122C	Q03207	126 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	EDE1	P34216	1381 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	MET17	P06106	444 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	GAC1	P28006	793 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	UBP11	P36026	717 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	MET28	P40573	187 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	FAR3	P46671	204 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YGR066C	P53242	292 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	IPI3	P53877	555 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	MSC1	Q03104	513 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.44	□□□□□ -1.7	not detected
RPC17	YJL011C	YBR144C	P34215	104 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	STV1	P37296	890 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	DOT5	P40553	215 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.44	□□□□□ -1.7	not detected

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