RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC8	Q8TAM2	541 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF14	Q15058	1648 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	DIP2B	Q9P265	1576 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP10	O43572	662 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	KATNA1	O75449	491 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	DDAH1	O94760	285 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ADH5	P11766	374 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MCM4	P33991	863 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GUCY2F	P51841	1108 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	BRD3	Q15059	726 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CD109	Q6YHK3	1445 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MIA2	Q96PC5	1412 aa		6.35	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	NCOA2	Q15596	1464 aa		6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TMPRSS2	O15393	492 aa		6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PREP	P48147	710 aa		6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CHPF	Q8IZ52	775 aa		6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	6.34	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM221A	A4D161	298 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ADCY3	O60266	1144 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	FGA	P02671	866 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF165	P49910	485 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	NEK2	P51955	445 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ID3	Q02535	119 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	CLC	Q05315	142 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP2R5E	Q16537	467 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ATL2	Q8NHH9	583 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		6.33	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	RFPL3	O75679	317 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	EYA4	O95677	639 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK8	P49336	464 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	INPP5A	Q14642	412 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	GK5	Q6ZS86	529 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	DYM	Q7RTS9	669 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	NEO1	Q92859	1461 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	CILP	O75339	1184 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVK-24	P63145	666 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	MPP2	Q14168	576 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	UVSSA	Q2YD98	709 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	CDH19	Q9H159	772 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	DISC1	Q9NRI5	854 aa		6.32	□□□□□ -1.4
EFHC1-223	ENST00000636616	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4

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