RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 PLCG1P19174 1290 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 VCAM1P19320 739 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 IGFALSP35858 605 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 HALP42357 657 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PPP2R2AP63151 447 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 GABREP78334 506 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PDE4BQ07343 736 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PCDH1Q08174 1060 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 GRB10Q13322 594 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SLC9A5Q14940 896 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 RGL3Q3MIN7 710 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ERAP2Q6P179 960 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CCDC174Q6PII3 467 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 HDXQ7Z353 690 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TPH2Q8IWU9 490 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 LRRN4CLQ8ND94 238 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 BSNDQ8WZ55 320 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PPP1R14AQ96A00 147 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TIFAQ96CG3 184 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 WNK4Q96J92 1243 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TNIP3Q96KP6 325 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SCLT1Q96NL6 688 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PBX4Q9BYU1 374 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 MUC3BQ9H195 1237 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CRISPLD1Q9H336 500 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ZFATQ9P243 1243 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 NRBP1Q9UHY1 535 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CFAP69A5D8W1 941 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 FAM83GA6ND36 823 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 FAM177BA6PVY3 158 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CCER2I3L3R5 266 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 GFRA2O00451 464 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 APAF1O14727 1248 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SLC26A4O43511 780 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 B3GALT4O96024 378 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 MYBL2P10244 700 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PF4V1P10720 104 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 BPIP17213 487 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 NFKB1P19838 968 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 NRLP54845 237 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SIK1P57059 783 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 AP3B2Q13367 1082 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 GBX1Q14549 363 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ZNF423Q2M1K9 1284 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 LCE4AQ5TA78 99 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 OVOS1Q6IE37 1185 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 FIGNL1Q6PIW4 674 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 BRAPQ7Z569 592 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 KIF18BQ86Y91 864 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 CPA6Q8N4T0 437 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 STK35Q8TDR2 534 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 COG1Q8WTW3 980 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 LUZP4Q9P127 313 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-220ENST00000635865 PCDHA4Q9UN74 947 aa3.11□□□□□ -1.91
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