RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-217	ENST00000629983	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-217	ENST00000629983	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-217	ENST00000629983	TIFA	Q96CG3	184 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-217	ENST00000629983	MYH8	P13535	1937 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-217	ENST00000629983	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	EYS	Q5T1H1	3165 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ATP5J	P18859	108 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	UBE3C	Q15386	1083 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	HAUS7	Q99871	368 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZNF576	Q9H609	170 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	VCAN	P13611	3396 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	TIMP1	P01033	207 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	CPXCR1	Q8N123	301 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	CCDC174	Q6PII3	467 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	USP38	Q8NB14	1042 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	32.8	■■■□□ 2.84	4e-6	■□□□□ 9.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	SPC25	Q9HBM1	224 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	MYADML2	A6NDP7	307 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	32.79	■■■□□ 2.84	2e-7	■□□□□ 8.5
CAPNS1-217	ENST00000629983	RIPK3	Q9Y572	518 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	PARP14	Q460N5	1801 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZBED4	O75132	1171 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	MS4A1	P11836	297 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	PPM1E	Q8WY54	764 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	TBX21	Q9UL17	535 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	NDUFB10	O96000	172 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	ACVR2B	Q13705	512 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	MFSD5	Q6N075	450 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-217	ENST00000629983		F5H6K3	240 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ASGR1	P07306	291 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	KLRC3	Q07444	240 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	KIFC2	Q96AC6	838 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ELP1	O95163	1332 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	NYAP2	Q9P242	653 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CDH23	Q9H251	3354 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	RASA1	P20936	1047 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	TMEM199	Q8N511	208 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CSF2RA	P15509	400 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	TMEM240	Q5SV17	173 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PBX2	P40425	430 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PBX4	Q9BYU1	374 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	FBXO40	Q9UH90	709 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ARVCF	O00192	962 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ACR	P10323	421 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ARMCX2	Q7L311	632 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ATP2A1	O14983	1001 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	ADCY6	O43306	1168 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	CDK7	P50613	346 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	SBK1	Q52WX2	424 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-217	ENST00000629983	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83

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