RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627688.1

PTENP1-AS-201, PTENP1 antisense RNA, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTENP1-AS, Length 873 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.46■■□□□ 1.03
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ICA1Q05084 483 aa21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 GJA9P57773 515 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TFF2Q03403 129 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CCDC17Q96LX7 622 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 VWA5AO00534 786 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CD4P01730 458 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 KCNQ1P51787 676 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DDX11Q96FC9 970 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.43■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CYP2C18P33260 490 aa21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 GNASQ5JWF2 1037 aa21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 HIPK3Q9H422 1215 aa21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.42■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MYADML2A6NDP7 307 aa21.41■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CABYRO75952 493 aa21.41■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NKX3-2P78367 333 aa21.41■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ACVR2BQ13705 512 aa21.41■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.41■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 GOPCQ9HD26 462 aa21.41■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 POLA2Q14181 598 aa21.4■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.4■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.4■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.39■■□□□ 1.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TLL1O43897 1013 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PFKMP08237 780 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 REPS2Q8NFH8 660 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SSH3Q8TE77 659 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.38■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.38■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.37■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RABGGTBP53611 331 aa21.37■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.37■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 HLA-CQ95604 372 aa21.37■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.37■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CACNA1AO00555 2505 aa21.37■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 AKR1B1P15121 316 aa21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ATP2A1O14983 1001 aa21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZEB2O60315 1214 aa21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ATP8B2P98198 1209 aa21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FBXO40Q9UH90 709 aa21.35■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZBBXA8MT70 800 aa21.34■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ITGA7Q13683 1181 aa21.34■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.34■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.34■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.34■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 REV3LO60673 3130 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MYOGP15173 224 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CCL23P55773 120 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ARMCX2Q7L311 632 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.33■■□□□ 1.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms