RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	SNX17	Q15036	470 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	RAB30	Q15771	203 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	PKN1	Q16512	942 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	FBN2	P35556	2912 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LINC01828-208	ENST00000626583	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ADH1A	P07327	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ACR	P10323	421 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PTGIR	P43119	386 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RELB	Q01201	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GRB10	Q13322	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GNB5	O14775	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	BBOX1	O75936	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NTSR2	O95665	410 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZXDA	P98168	799 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TLE2	Q04725	743 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TSC1	Q92574	1164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SPTA1	P02549	2419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	FYB1	O15117	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RAG1	P15918	1043 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GPT	P24298	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CCL14	Q16627	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	QPCT	Q16769	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF536	O15090	1300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TNKS	O95271	1327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TRIM66	O15016	1216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PRB1	P04280	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CLTB	P09497	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CYP2B6	P20813	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PML	P29590	882 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CHRNA4	P43681	627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms