RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623185.3

LINC00963-216, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 786 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-216ENST00000623185 PFKFB2O60825 505 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CYP2C8P10632 490 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 HERVK_113P62684 666 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ME3Q16798 604 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RTN1Q16799 776 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 MICU3Q86XE3 530 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 WBP1LQ9NX94 342 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 NID2Q14112 1375 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 VWA5AO00534 786 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ATP2A1O14983 1001 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ZBED4O75132 1171 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 TRPA1O75762 1119 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RXRAP19793 462 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CDC27P30260 824 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SLC16A2P36021 539 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 C17orf99Q6UX52 265 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SNX21Q969T3 373 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 KIFC2Q96AC6 838 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 MTMR8Q96EF0 704 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 PNMA2Q9UL42 364 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 OAZ1P54368 228 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 NBPF11Q86T75 865 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ATG4CQ96DT6 458 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CYTH3O43739 400 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 IFNAR1P17181 557 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 FUT2Q10981 343 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SCRN1Q12765 414 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 TRAF1Q13077 416 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CRHR2Q13324 411 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 NTRK3Q16288 839 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 REPS2Q8NFH8 660 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 MYH4Q9Y623 1939 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CPLX1O14810 134 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 ZBTB5O15062 677 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 TBC1D8O95759 1140 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 BCRP11274 1271 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 STK3Q13188 491 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 Q3C1V9 767 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CPVLQ9H3G5 476 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 BTBD7Q9P203 1132 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
LINC00963-216ENST00000623185 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 CNMDO75829 334 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 CDKL5O76039 1030 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 ICAM1P05362 532 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 STAT3P40763 770 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 CCNA1P78396 465 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 GTF3C6Q969F1 213 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 TMX3Q96JJ7 454 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00963-216ENST00000623185 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms