RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 KRT8P05787 483 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 GFAPP14136 432 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 PSEN1P49768 467 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 IFFO1Q0D2I5 559 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 NR5A1Q13285 461 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 CUL3Q13618 768 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RPS6KA1Q15418 735 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TCEAL5Q5H9L2 206 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 LDLRAP1Q5SW96 308 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 C6orf183Q5T699 404 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SCUBE3Q8IX30 993 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 C10orf67Q8IYJ2 551 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 AHI1Q8N157 1196 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RNF214Q8ND24 703 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 NCLNQ969V3 563 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 VMP1Q96GC9 406 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 PRIMPOLQ96LW4 560 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 KIF2CQ99661 725 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SPZ1Q9BXG8 430 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 COG4Q9H9E3 785 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 OLFML3Q9NRN5 406 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 EXOC1Q9NV70 894 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 KLF15Q9UIH9 416 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 LRFN2Q9ULH4 789 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TELO2Q9Y4R8 837 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 E9PMD0 336 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 AHSGP02765 367 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RXRAP19793 462 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ITIH2P19823 946 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 CDC27P30260 824 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 HSD17B3P37058 310 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SMTNP53814 917 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MYO1EQ12965 1108 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RASA3Q14644 834 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 AKAP4Q5JQC9 854 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC27A3Q5K4L6 730 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MEI1Q5TIA1 1274 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 BRINP3Q76B58 766 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TTC7BQ86TV6 843 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MCF2L2Q86YR7 1114 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SNX19Q92543 992 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 GLG1Q92896 1179 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 NGLY1Q96IV0 654 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 WNK4Q96J92 1243 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 CLSTN2Q9H4D0 955 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SETD5Q9C0A6 1442 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 GOLGA8AA7E2F4 631 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 GOLGA8BA8MQT2 603 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 VSTM5A8MXK1 200 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 PSMD14O00487 310 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SEC14L5O43304 696 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SNCGO76070 127 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 OAS2P29728 719 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 PHBP35232 272 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MTSS1LQ765P7 747 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MON1BQ7L1V2 547 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF438Q7Z4V0 828 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 DGKHQ86XP1 1220 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 NDUFAF2Q8N183 169 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM81AQ8TBF8 368 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TEKT4Q8WW24 435 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 NLRP7Q8WX94 980 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 DDX11Q96FC9 970 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TNIP3Q96KP6 325 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 FRMD6Q96NE9 622 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 TRIM7Q9C029 511 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 LRRC40Q9H9A6 602 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 MARK1Q9P0L2 795 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRQ-209ENST00000616559 SMCO3A2RU48 225 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.6 ms