RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613922.1

CCL3-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3, Length 778 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-204ENST00000613922 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.35■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.35■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 INCENPQ9NQS7 918 aa20.35■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 FEM1BQ9UK73 627 aa20.35■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 ZMYM6O95789 1325 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 ORC4O43929 436 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.34■□□□□ 0.85
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CCL3-204ENST00000613922 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 TSPY2A6NKD2 308 aa20.33■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 SEPT4O43236 478 aa20.33■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 ZBED4O75132 1171 aa20.33■□□□□ 0.85
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CCL3-204ENST00000613922 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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CCL3-204ENST00000613922 KCTD2Q14681 263 aa20.33■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
CCL3-204ENST00000613922 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.33■□□□□ 0.85
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CCL3-204ENST00000613922 KIFC2Q96AC6 838 aa20.32■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 GMCL1Q96IK5 515 aa20.32■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 DNM1LO00429 736 aa20.31■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 FDX1P10109 184 aa20.31■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 OAZ1P54368 228 aa20.31■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 NMT2O60551 498 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 PLA2G6O60733 806 aa20.3■□□□□ 0.84
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CCL3-204ENST00000613922 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 FAM160B2Q86V87 743 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 CPXCR1Q8N123 301 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 TINF2Q9BSI4 451 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 STX8Q9UNK0 236 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 SZT2Q5T011 3432 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 A0A1W2PPC1 479 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 TMEM232C9JQI7 657 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 SLC1A4P43007 532 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 STAT2P52630 851 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 GDF15Q99988 308 aa20.29■□□□□ 0.84
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CCL3-204ENST00000613922 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 MCCP23508 829 aa20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 CHST13Q8NET6 341 aa20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 FBXO40Q9UH90 709 aa20.28■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 BMP8BP34820 402 aa20.27■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 ANO1Q5XXA6 986 aa20.27■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.27■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 DDX11Q96FC9 970 aa20.27■□□□□ 0.84
CCL3-204ENST00000613922 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.27■□□□□ 0.83
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CCL3-204ENST00000613922 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.26■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 ZNF536O15090 1300 aa20.26■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 LAMA3Q16787 3333 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 KBTBD13C9JR72 458 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 SYN1P17600 705 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 SLC4A3P48751 1232 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 HAND2P61296 217 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 LRRC41Q15345 812 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 KCTD1Q719H9 257 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 DCAF4Q8WV16 495 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 FGD4Q96M96 766 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 TOMM22Q9NS69 142 aa20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 HIP1O00291 1037 aa20.24■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCL3-204ENST00000613922 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.24■□□□□ 0.83
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