RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC23AQ15436 765 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 AMHR2Q16671 573 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SHC4Q6S5L8 630 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC8AQ8IWT6 810 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC112Q8NEF3 446 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GOPCQ9HD26 462 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KCND1Q9NSA2 647 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GJB4Q9NTQ9 266 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM75PA6NK02 468 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NPHP1O15259 732 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FGRP09769 529 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SKILP12757 684 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 RXRBP28702 533 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF5BP33176 963 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF11Q86T75 865 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FERMT2Q96AC1 680 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 AFF2P51816 1311 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 BTBD18B2RXH4 712 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SNAP23O00161 211 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 BIN1O00499 593 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TNNT1P13805 278 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC10P48553 1259 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LRMPQ12912 555 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 POSTNQ15063 836 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SYCP1Q15431 976 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SBK1Q52WX2 424 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 MLKLQ8NB16 471 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 HPS1Q92902 700 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SMARCE1Q969G3 411 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 USP21Q9UK80 565 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 BTAF1O14981 1849 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNQ2O43526 872 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINC1P01008 464 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 JUNDP17535 347 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CALML3P27482 149 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FANCCQ00597 558 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 MECOMQ03112 1051 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TMC6Q7Z403 805 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 INCENPQ9NQS7 918 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 IFNKQ9P0W0 207 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNJ14Q9UNX9 436 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 BAG3O95817 575 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LDHCP07864 332 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFV2P19404 249 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAQP50148 359 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCZ1BP86790 482 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PNOCQ13519 176 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN14Q15678 1187 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP135Q66GS9 1140 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CTR9Q6PD62 1173 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TREML4Q6UXN2 200 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF20Q9BVI0 1012 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 269.5 ms