RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578773.1

GGA3-206, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-206	ENST00000578773	FCER1A	P12319	257 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	ALAD	P13716	330 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	KCNA5	P22460	613 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	USP14	P54578	494 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	BEX3	Q00994	111 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	COG2	Q14746	738 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	MMP19	Q99542	508 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773		A0A1B0GUL7	405 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	GFRA3	O60609	400 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	GSTO1	P78417	241 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	TCF15	Q12870	199 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	SEPT2	Q15019	361 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	MROH8	Q9H579	483 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	B4GALT4	O60513	344 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	KRT37	O76014	449 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	DSG3	P32926	999 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	MCAM	P43121	646 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-206	ENST00000578773	ASTN1	O14525	1302 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	SHMT1	P34896	483 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	TFCP2	Q12800	502 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	LCT	P09848	1927 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	PSMC6	P62333	389 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FLOT1	O75955	427 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	GJA9	P57773	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	PPP4C	P60510	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FOXK2	Q01167	660 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	ZP2	Q05996	745 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FGD4	Q96M96	766 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	ZNF536	O15090	1300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CYP2C9	P11712	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	IRS1	P35568	1242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	PLCD1	P51178	756 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-206	ENST00000578773	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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