RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 DPH6Q7L8W6 267 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF511Q8NB15 262 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 TINF2Q9BSI4 451 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 GREM2Q9H772 168 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 RNF19AQ9NV58 838 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 HYPKQ9NX55 129 aa6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 MSCO60682 206 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 KCNQ1P51787 676 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 COPS2P61201 443 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 FANCCQ00597 558 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 EHHADHQ08426 723 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ADGRE1Q14246 886 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 NFE2L2Q16236 605 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 LINC01559Q495D7 138 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CACNA1FO60840 1977 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF236Q9UL36 1845 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.54□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 TLL1O43897 1013 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 SORBS3O60504 671 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 SCTRP47872 440 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 EPHA4P54764 986 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 TFF2Q03403 129 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CHRNDQ07001 517 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 C16orf46Q6P387 395 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 HERVK_113Q902F9 699 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 LPAR1Q92633 364 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 RNF34Q969K3 372 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 FAM129BQ96TA1 746 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 MRIQ9BWK5 157 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.53□□□□□ -1.36
TRIM25-208ENST00000574234 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TNFRSF10BO14763 440 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 BACH1O14867 736 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CYP2B6P20813 491 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MAPK8P45983 427 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CACNB3P54284 484 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 FAM151AQ8WW52 585 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TEKT1Q969V4 418 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 FBXL18Q96ME1 805 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MYD88Q99836 296 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PBX4Q9BYU1 374 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MRS2Q9HD23 443 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.375e-10■■■■□ 23.5
TRIM25-208ENST00000574234 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 COG5Q9UP83 839 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DMDP11532 3685 aa6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 A0A1W2PRU2 124 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 GPR182O15218 404 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PTPRAP18433 802 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ITGA6P23229 1130 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 EPHB4P54760 987 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ERVK-9P63128 1117 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 FPGSQ05932 587 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PSMD2Q13200 908 aa6.51□□□□□ -1.37
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