RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	HIP1	O00291	1037 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ORC4	O43929	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PGK2	P07205	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	FDX1	P10109	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CYBA	P13498	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MCC	P23508	829 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC1A4	P43007	532 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SEPT4	O43236	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	NMT2	O60551	498 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	COL6A1	P12109	1028 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	STAT2	P52630	851 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	OAZ1	P54368	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF213	O14771	459 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G6	O60733	806 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	NOV	P48745	357 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	HAND2	P61296	217 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PFAS	O15067	1338 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH8	P13535	1937 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RLF	Q13129	1914 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DNM1L	O00429	736 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC14	Q96N46	770 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE4A	P27815	886 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	ESR2	Q92731	530 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.08	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0G2JMZ2	1700 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	RARB	P10826	455 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	SYN1	P17600	705 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	NT5C2	P49902	561 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	SNAP25	P60880	206 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.07	□□□□□ -0.64
KIFC3-231	ENST00000567479	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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