RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	COBL	O75128	1261 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	HMGCR	P04035	888 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ADORA2A	P29274	412 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	STAT3	P40763	770 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	STAT2	P52630	851 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SNAP25	P60880	206 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC14	Q96N46	770 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	APBA2	Q99767	749 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT23	Q9C075	422 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	MROH8	Q9H579	483 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBED4	O75132	1171 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC25A27	O95847	323 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXC6	P09630	235 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC16A2	P36021	539 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	TNKS	O95271	1327 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985		E7EWF7	191 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	STRN	O43815	780 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PLA2G6	O60733	806 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC45	O75419	566 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	GJB1	P08034	283 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PDHB	P11177	359 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	NT5C2	P49902	561 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SEC23A	Q15436	765 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP19	Q99542	508 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF536	O15090	1300 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHA2	P01877	340 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PGK2	P07205	417 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	FCER1A	P12319	257 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TPCN1-223	ENST00000552985	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC27A2	O14975	620 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP2C19	P33261	490 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	COPB2	P35606	906 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	GJA8	P48165	433 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	OAZ1	P54368	228 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	ANTXR2	P58335	489 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TPCN1-223	ENST00000552985	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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