RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 TOMM22Q9NS69 142 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PFASO15067 1338 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 FGAP02671 866 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 COL6A1P12109 1028 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ANO1Q5XXA6 986 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM232C9JQI7 657 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 NMT2O60551 498 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 SDSP20132 328 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 RIPK3Q9Y572 518 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 SEPT4O43236 478 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 MCCP23508 829 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC1A4P43007 532 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 DDX11Q96FC9 970 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 GMCL1Q96IK5 515 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 PARP14Q460N5 1801 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP2A1O14983 1001 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ORC4O43929 436 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 STAT2P52630 851 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 TINF2Q9BSI4 451 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 MTMR7Q9Y216 660 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ARRDC4Q8NCT1 418 aa29.51■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CHURC1Q8WUH1 139 aa29.51■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 DNM1LO00429 736 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 SYN1P17600 705 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 HAND2P61296 217 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC26Q2I0M4 334 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM160B2Q86V87 743 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 FGRP09769 529 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 FDX1P10109 184 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 OAZ1P54368 228 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 KCTD1Q719H9 257 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 PRO3102Q9H379 93 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 FBXO40Q9UH90 709 aa29.48■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.48■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 ZMYM6O95789 1325 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 KBTBD13C9JR72 458 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 RCSD1Q6JBY9 416 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CHST13Q8NET6 341 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 MYH4Q9Y623 1939 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 HIP1O00291 1037 aa29.45■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC96Q2M329 555 aa29.45■■■□□ 2.31
PTPRJ-206ENST00000534219 RARBP10826 455 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 NOVP48745 357 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 RASGRP2Q7LDG7 609 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF213O14771 459 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 PLA2G6O60733 806 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC174Q6PII3 467 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 DCAF4Q8WV16 495 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 GDF15Q99988 308 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 ALPK3Q96L96 1907 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 SNAP25P60880 206 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC41Q15345 812 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 ACAD9Q9H845 621 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-206ENST00000534219 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.2 ms