RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 TRPV1Q8NER1 839 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 NEDD4P46934 1319 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 HOXC6P09630 235 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ERCC3P19447 782 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 COG2Q14746 738 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ATG4CQ96DT6 458 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 SLC27A2O14975 620 aa21.95■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 NOVP48745 357 aa21.95■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 DPP9Q86TI2 863 aa21.95■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.95■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 CYBAP13498 195 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 BMP8BP34820 402 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 ANO1Q5XXA6 986 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 LPAR1Q92633 364 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 CEP95Q96GE4 821 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 SH2D4AQ9H788 454 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 VCPKMTQ9H867 229 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TMX2Q9Y320 296 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MYH4Q9Y623 1939 aa21.94■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 E7EWF7 191 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 RAD21O60216 631 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 NMT2O60551 498 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 DSG3P32926 999 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TDHQ8IZJ6 230 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.93■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TSPY2A6NKD2 308 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 B4E1Z4 1266 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 COBLO75128 1261 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 SEC24BO95487 1268 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TSPY3P0CV98 308 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TSPY8P0CW00 308 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MB21D1Q8N884 522 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 KCNB2Q92953 911 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MKL1Q969V6 931 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 USP26Q9BXU7 913 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 NYAP2Q9P242 653 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MSCO60682 206 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 C8orf34Q49A92 452 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 RASEFQ8IZ41 740 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TOMM22Q9NS69 142 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 DNM1LO00429 736 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 KDM4AO75164 1064 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 IGHA2P01877 340 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 Q7L0L9 218 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-218ENST00000531995 REC8O95072 547 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 HSPA4P34932 840 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 ESR2Q92731 530 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 KRT23Q9C075 422 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 STRNO43815 780 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 MROH8Q9H579 483 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 GOPCQ9HD26 462 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 TTLL1O95922 423 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 NT5C2P49902 561 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 RTP1P59025 263 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 MAML3Q96JK9 1138 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 KBTBD13C9JR72 458 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 PGK2P07205 417 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 FCER1AP12319 257 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-218ENST00000531995 ANTXR2P58335 489 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms