RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 IQUBQ8NA54 791 aa8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 SHISA4Q96DD7 197 aa8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 TRIM5Q9C035 493 aa8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 SCN9AQ15858 1988 aa8.59□□□□□ -1.03
PACS1-211ENST00000531298 MYH4Q9Y623 1939 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 SMIM22K7EJ46 135 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 STXBP3O00186 592 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CYTH3O43739 400 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 NMT2O60551 498 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PDHBP11177 359 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 TXLNAP40222 546 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 BAG6P46379 1132 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 MORC3Q14149 939 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 NCAPHQ15003 741 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 LONRF3Q496Y0 759 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CCDC93Q567U6 631 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 OXER1Q8TDS5 423 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 DCAF4Q8WV16 495 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 SPOCK2Q92563 424 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 SMARCE1Q969G3 411 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CEP95Q96GE4 821 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 GINM1Q9NU53 330 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 USP40Q9NVE5 1235 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 STX8Q9UNK0 236 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 SIPA1L1O43166 1804 aa8.58□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 MAP3K13O43283 966 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 AP5Z1O43299 807 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 NRDCO43847 1150 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 ECE2O60344 883 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D12O60347 775 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 SHMT1P34896 483 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 TGFB2P61812 414 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 ZNF543Q08ER8 600 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PTGDRQ13258 359 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 E2F4Q16254 413 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 FBXO41Q8TF61 875 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 FAM212AQ96EL1 285 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CSRNP2Q9H175 543 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 RMND1Q9NWS8 449 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 STK24Q9Y6E0 443 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.57□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PLA2G6O60733 806 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PPFIA3O75145 1194 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PDIA5Q14554 519 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 KCNB1Q14721 858 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 TTLL6Q8N841 843 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 GMCL1Q96IK5 515 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CLIC6Q96NY7 704 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 RAB34Q9BZG1 259 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.56□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 RIMBP2O15034 1052 aa8.55□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 CCP110O43303 1012 aa8.55□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 TPM2P07951 284 aa8.55□□□□□ -1.04
PACS1-211ENST00000531298 ZNF18P17022 549 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms