RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX11Q96FC9 970 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRJ-205ENST00000527952 TEX13BQ9BXU2 312 aa28.69■■■□□ 2.18
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PTPRJ-205ENST00000527952 MCCP23508 829 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRJ-205ENST00000527952 CNTN2Q02246 1040 aa28.56■■■□□ 2.16
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PTPRJ-205ENST00000527952 RASGRP2Q7LDG7 609 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRJ-205ENST00000527952 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRJ-205ENST00000527952 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRJ-205ENST00000527952 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PTPRJ-205ENST00000527952 MTMR7Q9Y216 660 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA0355O15063 1070 aa28.55■■■□□ 2.16
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