RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 NAPAP54920 295 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 JAG1P78504 1218 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 SHC4Q6S5L8 630 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 DCAF4Q8WV16 495 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 RESP18Q5W5W9 173 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 CLIC6Q96NY7 704 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 TNNI2P48788 182 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 TTC38Q5R3I4 469 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 MICALL2Q8IY33 904 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 RNF214Q8ND24 703 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 HPSEQ9Y251 543 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 SLFN13Q68D06 897 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 KCTD1Q719H9 257 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 EGFRP00533 1210 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 ESYT2A0FGR8 921 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 WNT7AO00755 349 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 SLC1A4P43007 532 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 TYRO3Q06418 890 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 TNFAIP1Q13829 316 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 C6orf50Q9HD87 102 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-204ENST00000525861 ZNF202O95125 648 aa26.58■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 GNA11P29992 359 aa26.58■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.58■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.57■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.57■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.57■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 SMCO2A6NFE2 343 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 F5H6K3 240 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 RAD21O60216 631 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 MAP3K10Q02779 954 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 KLRC3Q07444 240 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 MTMR8Q96EF0 704 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 GMCL1Q96IK5 515 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 SYKP43405 635 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 RASA3Q14644 834 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ZNF174Q15697 407 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 SDF4Q9BRK5 362 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 SLC16A2P36021 539 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 TIGD1Q96MW7 591 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 GRIN1Q05586 938 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB5O15062 677 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 NDUFB10O96000 172 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 FERMT2Q96AC1 680 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 A0A1W2PRG0 241 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 LMNB1P20700 586 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 USP17L10C9JJH3 530 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 PTGDRQ13258 359 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 COA7Q96BR5 231 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 CAP2P40123 477 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 UVSSAQ2YD98 709 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 TEPSINQ96N21 525 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 CSRNP2Q9H175 543 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 MCM7P33993 719 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 SPECC1Q5M775 1068 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 HACL1Q9UJ83 578 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 TMX2Q9Y320 296 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 INF2Q27J81 1249 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 H7C1D1 291 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 BMP3P12645 472 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 ADCY7P51828 1080 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 ECE1P42892 770 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-204ENST00000525861 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms