RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	BRD1	O95696	1058 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	IGHA2	P01877	340 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	APP	P05067	770 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	FGD1	P98174	961 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ME3	Q16798	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131		Q6ZUG5	572 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	KRT23	Q9C075	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	PFKFB2	O60825	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	GH2	P01242	217 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	HOXC6	P09630	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	VCAM1	P19320	739 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	TDO2	P48775	406 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	GRB14	Q14449	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	LARGE1	O95461	756 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	PTPRE	P23469	700 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	CCNA1	P78396	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	BRF1	Q92994	677 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	EHD4	Q9H223	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-223	ENST00000524131	DNM1L	O00429	736 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PRC1	O43663	620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	MSC	O60682	206 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CYBA	P13498	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	HAND2	P61296	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	LPAR1	Q92633	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	FEZ1	Q99689	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	REV3L	O60673	3130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	GJB2	P29033	226 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CYP2C19	P33261	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	LIFR	P42702	1097 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	RCAN1	P53805	252 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	USP14	P54578	494 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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