RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 MYO1BO43795 1136 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 SMC2O95347 1197 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 HOMER1Q86YM7 354 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 IDI2Q9BXS1 227 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 DACH1Q9UI36 760 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 LRMPQ12912 555 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 AOC3Q16853 763 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 PAGE5Q96GU1 130 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 PIGSQ96S52 555 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 C6orf50Q9HD87 102 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 IFNKQ9P0W0 207 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 E2F4Q16254 413 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 ESYT2A0FGR8 921 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 NEMFO60524 1076 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 GNA11P29992 359 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 INF2Q27J81 1249 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC17Q96LX7 622 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 SMCO2A6NFE2 343 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 FANCCQ00597 558 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 DNAJC18Q9H819 358 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 TERF1P54274 439 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 SOGA3Q5TF21 947 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 IQUBQ8NA54 791 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.97■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 LAD1O00515 517 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF543Q08ER8 600 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 DPYDQ12882 1025 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 ILDR2Q71H61 639 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 ATP1A3P13637 1013 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 AFMP43652 599 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
PDE4D-223ENST00000515011 CACNB3P54284 484 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 GSDMDP57764 484 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PRPHP41219 470 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 GSDMAQ96QA5 445 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.95■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 MYH4Q9Y623 1939 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 FANCLQ9NW38 375 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PSME4Q14997 1843 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 TXLNAP40222 546 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 TCP10Q12799 353 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PPIP5K2O43314 1243 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 CBFA2T2O43439 604 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ARID5BQ14865 1188 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 YDJCA8MPS7 323 aa25.92■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.92■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 C21orf2O43822 256 aa25.91■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 SLURP2P0DP57 97 aa25.91■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.91■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 CASP1P29466 404 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 TMC6Q7Z403 805 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 NEK8Q86SG6 692 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 SERPINC1P01008 464 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-223ENST00000515011 UBASH3AP57075 661 aa25.9■■□□□ 1.74
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