RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SLFN12Q8IYM2 578 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 MYO1HQ8N1T3 1032 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 KCT2Q8NC54 265 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SLC39A13Q96H72 371 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CDH19Q9H159 772 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SLC5A4Q9NY91 659 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 REV1Q9UBZ9 1251 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 LTBP3Q9NS15 1303 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ACRP10323 421 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CD68P34810 354 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM102BQ5T8I3 360 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 RUFY4Q6ZNE9 571 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GSTCDQ8NEC7 633 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CEP164Q9UPV0 1460 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 GNPTABQ3T906 1256 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 MAP9Q49MG5 647 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 SHISA5Q8N114 240 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GPBAR1Q8TDU6 330 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SCYL1Q96KG9 808 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 EXOC2Q96KP1 924 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SLC13A1Q9BZW2 595 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 PCDHA4Q9UN74 947 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CORINQ9Y5Q5 1042 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DNMBPQ6XZF7 1577 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 PLCG1P19174 1290 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NTF4P34130 210 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 C19orf57Q0VDD7 668 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 POMZP3Q6PJE2 187 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC9A7Q96T83 725 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF11O15085 1522 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CLASP1Q7Z460 1538 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 FANCGO15287 622 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GRIN3BO60391 1043 aa2.9□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 PHKG2P15735 406 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 BPIP17213 487 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 IGFALSP35858 605 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ERVK-24P63145 666 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RING1Q06587 406 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 LRFN4Q6PJG9 635 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ACAD11Q709F0 780 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 C12orf40Q86WS4 652 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ELMO3Q96BJ8 720 aa2.9□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CORO1BQ9BR76 489 aa2.9□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 PRDM11Q9NQV5 511 aa2.9□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 FANCD2Q9BXW9 1451 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 FBXO21O94952 628 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 RAG1P15918 1043 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 NOS3P29474 1203 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PREPP48147 710 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 IREB2P48200 963 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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