RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	NCOR1	O75376	2440 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	FAAP100	Q0VG06	881 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	HAUS7	Q99871	368 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	MUC3A	Q02505	3323 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	ACLY	P53396	1101 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
SIMC1-208	ENST00000495423	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	CTR9	Q6PD62	1173 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	CHGB	P05060	677 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJB2	P25686	324 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	GBF1	Q92538	1859 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	TIMP1	P01033	207 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	GRIN2C	Q14957	1233 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	RAD21	O60216	631 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	KCNA10	Q16322	511 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	ELP1	O95163	1332 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	DDX11	Q96FC9	970 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	NYAP2	Q9P242	653 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	RIPK3	Q9Y572	518 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	RASA1	P20936	1047 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	CDK7	P50613	346 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	SBK1	Q52WX2	424 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SIMC1-208	ENST00000495423	MYADML2	A6NDP7	307 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423		F5H6K3	240 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	KLRC3	Q07444	240 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF576	Q9H609	170 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	NDUFB10	O96000	172 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	USP38	Q8NB14	1042 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ACVR2B	Q13705	512 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	TIFA	Q96CG3	184 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ADCY6	O43306	1168 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	GJA9	P57773	515 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC174	Q6PII3	467 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	FGD4	Q96M96	766 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ZBED4	O75132	1171 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	ASGR1	P07306	291 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SIMC1-208	ENST00000495423	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.59	■■■□□ 2.01

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