RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PGK2P07205 417 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRPV1Q8NER1 839 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM232C9JQI7 657 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ORC4O43929 436 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NMT2O60551 498 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MSCO60682 206 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHA2P01877 340 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAML3Q96JK9 1138 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGRP09769 529 aa22.83■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC1A4P43007 532 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX11Q96FC9 970 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GMCL1Q96IK5 515 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RIPK3Q9Y572 518 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH4Q9Y623 1939 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIP1O00291 1037 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP2A1O14983 1001 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STAT2P52630 851 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTMR7Q9Y216 660 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZMYM6O95789 1325 aa22.81■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FDX1P10109 184 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANO1Q5XXA6 986 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCTD1Q719H9 257 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM160B2Q86V87 743 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PFASO15067 1338 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEPT4O43236 478 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL6A1P12109 1028 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OAZ1P54368 228 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TINF2Q9BSI4 451 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.78■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHST13Q8NET6 341 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOVP48745 357 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC96Q2M329 555 aa22.76■■□□□ 1.23
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.76■■□□□ 1.23
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.75■■□□□ 1.23
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.75■■□□□ 1.23
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC174Q6PII3 467 aa22.74■■□□□ 1.23
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTC22Q5TAA0 569 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ESR2Q92731 530 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTC14Q96N46 770 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RARBP10826 455 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ALAS1P13196 640 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
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