RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 MRS2Q9HD23 443 aa5.36□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 ZFYVE9O95405 1425 aa5.36□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 NOS1P29475 1434 aa5.36□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa5.36□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 ABCA6Q8N139 1617 aa5.36□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 ABCC3O15438 1527 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 USP47Q96K76 1375 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 ANP32CO43423 234 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 RAPGEF3O95398 923 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 CBX7O95931 251 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 RLBP1P12271 317 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 LMNB1P20700 586 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 KIR3DL1P43629 444 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 RHOVQ96L33 236 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.35□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 NPATQ14207 1427 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 KRT1P04264 644 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 CYP7A1P22680 504 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 CFPP27918 469 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 TNK2Q07912 1038 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 GIPC2Q8TF65 315 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 UBE2FQ969M7 185 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 TSPOAP1O95153 1857 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 KIF1BO60333 1816 aa5.34□□□□□ -1.55
RARB-208ENST00000489694 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.34□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.34□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CCDC7Q96M83 1385 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 RAC2P15153 192 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 GGT6Q6P531 493 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 DIRC2Q96SL1 478 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 PIK3C2BO00750 1634 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ADGRB3O60242 1522 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.33□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 FAM221AA4D161 298 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 PF4P02776 101 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 LMNB2Q03252 620 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TTC6Q86TZ1 520 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CDH24Q86UP0 819 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CLTCL1P53675 1640 aa5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 NFIBO00712 420 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CILPO75339 1184 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 F13A1P00488 732 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ESR1P03372 595 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 PGRP06401 933 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 C1QTNF9P0C862 333 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ETV3P41162 512 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TMF1P82094 1093 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 ABHD4Q8TB40 342 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TMEM87BQ96K49 555 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TMEM74Q96NL1 305 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.31□□□□□ -1.56
RARB-208ENST00000489694 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms