RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.19■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ERC2O15083 957 aa20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 RARBP10826 455 aa20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 KIFC2Q96AC6 838 aa20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.18■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PGK1P00558 417 aa20.17■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 CPXCR1Q8N123 301 aa20.17■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL1O95922 423 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 MX1P20591 662 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC4A3P48751 1232 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 MKL1Q969V6 931 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 NAPBQ9H115 298 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PHF24Q9UPV7 400 aa20.16■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP2A1O14983 1001 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPY3P0CV98 308 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPY8P0CW00 308 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 AKR1A1P14550 325 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 PPARAQ07869 468 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.15■□□□□ 0.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXP2O15409 715 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBED4O75132 1171 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 PDE4BQ07343 736 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SLFN13Q68D06 897 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF180Q86T96 592 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX11Q96FC9 970 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 FEM1BQ9UK73 627 aa20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PQY0 241 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS4O75173 837 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 TFAP4Q01664 338 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 TLE2Q04725 743 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 BADQ92934 168 aa20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 BMP3P12645 472 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 FGD4Q96M96 766 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.12■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SHHQ15465 462 aa20.11■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.11■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.11■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.11■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 VCANP13611 3396 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM232C9JQI7 657 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ADCY6O43306 1168 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 STAT2P52630 851 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 OAZ1P54368 228 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS53Q5VIR6 699 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 GMCL1Q96IK5 515 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CRBNQ96SW2 442 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 INCENPQ9NQS7 918 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 LCTP09848 1927 aa20.1■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 MYADML2A6NDP7 307 aa20.09■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 POTEB2H3BUK9 544 aa20.09■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 CLTBP09497 229 aa20.09■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGB8P26012 769 aa20.09■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ACLYP53396 1101 aa20.09■□□□□ 0.81
SKIV2L-211ENST00000485349 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms