RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
USP40-215ENST00000484528 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.64■■□□□ 1.7
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USP40-215ENST00000484528 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.64■■□□□ 1.7
USP40-215ENST00000484528 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.64■■□□□ 1.7
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USP40-215ENST00000484528 MKL1Q969V6 931 aa25.63■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 TINF2Q9BSI4 451 aa25.63■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 ZBED4O75132 1171 aa25.62■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 EVI5LQ96CN4 794 aa25.62■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 LNPKQ9C0E8 428 aa25.61■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.61■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 LRRC41Q15345 812 aa25.6■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 FERMT2Q96AC1 680 aa25.6■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 FEM1BQ9UK73 627 aa25.6■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.59■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 FAM227BQ96M60 508 aa25.59■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.59■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 TSPY2A6NKD2 308 aa25.58■■□□□ 1.69
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USP40-215ENST00000484528 STX8Q9UNK0 236 aa25.58■■□□□ 1.69
USP40-215ENST00000484528 PGK1P00558 417 aa25.57■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 RARBP10826 455 aa25.57■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.57■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.57■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.57■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 MTMR7Q9Y216 660 aa25.57■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.56■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.55■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.55■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 TOMM22Q9NS69 142 aa25.55■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 AKR1A1P14550 325 aa25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 SLC1A4P43007 532 aa25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 STAT2P52630 851 aa25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 KCTD1Q719H9 257 aa25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 GMCL1Q96IK5 515 aa25.54■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
USP40-215ENST00000484528 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.53■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 RILPL2Q969X0 211 aa25.53■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.52■■□□□ 1.68
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USP40-215ENST00000484528 FGAP02671 866 aa25.51■■□□□ 1.67
USP40-215ENST00000484528 HAND2P61296 217 aa25.51■■□□□ 1.67
USP40-215ENST00000484528 SNX17Q15036 470 aa25.51■■□□□ 1.67
USP40-215ENST00000484528 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.51■■□□□ 1.67
USP40-215ENST00000484528 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.51■■□□□ 1.67
USP40-215ENST00000484528 CCDC174Q6PII3 467 aa25.51■■□□□ 1.67
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