RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 CCL15Q16663 113 aa30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 VCPKMTQ9H867 229 aa30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 CHMP5Q9NZZ3 219 aa30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SLC1A4P43007 532 aa30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 PPIL2Q13356 520 aa30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 CCDC96Q2M329 555 aa30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 TRIM22Q8IYM9 498 aa30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 KIF3AQ9Y496 699 aa30.02■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 PPATQ06203 517 aa30.01■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.01■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 FEZ1Q99689 392 aa30.01■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.01■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SYT1P21579 422 aa30.01■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 SMARCA1P28370 1054 aa30.01■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 KCTD1Q719H9 257 aa30.01■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ZNF280CQ8ND82 737 aa30.01■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.01■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.01■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 USP17L10C9JJH3 530 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 CYTH3O43739 400 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 PDCP20941 246 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 SPP2Q13103 211 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 PKP1Q13835 747 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 IFFO2Q5TF58 517 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 FAM43AQ8N2R8 423 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 SPZ1Q9BXG8 430 aa30■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 DEXIO95424 95 aa29.99■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ALDH1A1P00352 501 aa29.99■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 CPVLQ9H3G5 476 aa29.99■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 GPR25O00155 361 aa29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 BMP3P12645 472 aa29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 SNAPC2Q13487 334 aa29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 MTMR2Q13614 643 aa29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 V9GY48 417 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 BACE1P56817 501 aa29.97■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 NUCB2P80303 420 aa29.97■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.97■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.97■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.97■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 STX6O43752 255 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 CETPP11597 493 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 USP14P54578 494 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 CRHR2Q13324 411 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 PKN1Q16512 942 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 WASF1Q92558 559 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 AIFM3Q96NN9 605 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 PARP14Q460N5 1801 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 TRIM75PA6NK02 468 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 BTBD19C9JJ37 291 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 LPAR1Q92633 364 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ALG1Q9BT22 464 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.96■■■□□ 2.39
SOBP-202ENST00000477448 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.95■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.95■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.95■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 C19orf81C9J6K1 198 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 CAPN15O75808 1086 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 BRD1O95696 1058 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 DGKZQ13574 1117 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 MTMR6Q9Y217 621 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.94■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 SLC16A2P36021 539 aa29.93■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 MOGSQ13724 837 aa29.93■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 BTNL9Q6UXG8 535 aa29.93■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.93■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 C8orf76Q96K31 380 aa29.93■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 TMEM232C9JQI7 657 aa29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 FOSBP53539 338 aa29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 C12orf42Q96LP6 360 aa29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.92■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 H3BQV1 296 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 SCG2P13521 617 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 VCAM1P19320 739 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 HMGCS2P54868 508 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.91■■■□□ 2.38
SOBP-202ENST00000477448 RGS22Q8NE09 1264 aa29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms