RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 MKL1Q969V6 931 aa22.94■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 NAPBQ9H115 298 aa22.94■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.94■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 TTLL1O95922 423 aa22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 TSPY3P0CV98 308 aa22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 TSPY8P0CW00 308 aa22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 PDE4BQ07343 736 aa22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 RNF180Q86T96 592 aa22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 AKR1A1P14550 325 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 TFAP4Q01664 338 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 SNX17Q15036 470 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 FEM1BQ9UK73 627 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 PHF24Q9UPV7 400 aa22.92■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ATP2A1O14983 1001 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 MX1P20591 662 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 PPARAQ07869 468 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 SLFN13Q68D06 897 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 BADQ92934 168 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 PARP14Q460N5 1801 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 TLE2Q04725 743 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.9■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 BMP3P12645 472 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM232C9JQI7 657 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SHHQ15465 462 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 A0A1W2PQY0 241 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CHST13Q8NET6 341 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 INCENPQ9NQS7 918 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO40Q9UH90 709 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 POTEB2H3BUK9 544 aa22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 ADAMTS4O75173 837 aa22.86■■□□□ 1.25
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SHQ1-206ENST00000471526 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FAM161BQ96MY7 647 aa22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TSPY2A6NKD2 308 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SLC1A4P43007 532 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 STAT2P52630 851 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 ACLYP53396 1101 aa22.85■■□□□ 1.25
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SHQ1-206ENST00000471526 ACVR2BQ13705 512 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CRBNQ96SW2 442 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 STX8Q9UNK0 236 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 DLL1O00548 723 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FOXP2O15409 715 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 CLTBP09497 229 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FDX1P10109 184 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 KCNA10Q16322 511 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 FAM160B2Q86V87 743 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 NMT2O60551 498 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-206ENST00000471526 RAG1P15918 1043 aa22.83■■□□□ 1.25
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