RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOMM22Q9NS69 142 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAD50Q92878 1312 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 NT5C2P49902 561 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC1A4P43007 532 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 STAT2P52630 851 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 OAZ1P54368 228 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIFC2Q96AC6 838 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 MMP19Q99542 508 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF213O14771 459 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 COBLO75128 1261 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBED4O75132 1171 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 FDX1P10109 184 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCTD2Q14681 263 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM160B2Q86V87 743 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALPK3Q96L96 1907 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLA2G6O60733 806 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEDD4P46934 1319 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM232C9JQI7 657 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYBAP13498 195 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCCP23508 829 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP2C19P33261 490 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCAF4Q8WV16 495 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 ESR2Q92731 530 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAML3Q96JK9 1138 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 MSCO60682 206 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 LHX8Q68G74 356 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL25Q9H293 177 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIPK3Q9Y572 518 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CPXCR1Q8N123 301 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTC14Q96N46 770 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMLP26374 656 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCTD1Q719H9 257 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPV1Q8NER1 839 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPF3Q92784 378 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO40Q9UH90 709 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-208ENST00000469521 PGK2P07205 417 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC96Q2M329 555 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHST13Q8NET6 341 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNGA1P29973 690 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF536O15090 1300 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEPT4O43236 478 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 IQCA1Q86XH1 822 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 DGKHQ86XP1 1220 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 TINF2Q9BSI4 451 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTMR7Q9Y216 660 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 H0YGN5 161 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 KDM4AO75164 1064 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDHBP11177 359 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 TKFCQ3LXA3 575 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX11Q96FC9 970 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRT23Q9C075 422 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACAD9Q9H845 621 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 B4E1Z4 1266 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNHG28P0DPA3 235 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL6A1P12109 1028 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC4A3P48751 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP290O15078 2479 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 PFASO15067 1338 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.15■■□□□ 1.14
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