RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469061.1

CNTNAP3-208, Transcript of contactin associated protein like 3, human

TSL 3

Gene CNTNAP3, Length 417 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SEPT4	O43236	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PGK2	P07205	417 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TFAP4	Q01664	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GBF1	Q92538	1859 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ORC4	O43929	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	STAT2	P52630	851 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	OAZ1	P54368	228 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ALX1	Q15699	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NMT2	O60551	498 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	BMP3	P12645	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SYN1	P17600	705 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NUCB1	Q02818	461 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GDF15	Q99988	308 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZBED4	O75132	1171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FGR	P09769	529 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FDX1	P10109	184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SLC1A4	P43007	532 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	IGHD	P01880	384 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	FGA	P02671	866 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RARB	P10826	455 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	AKR1A1	P14550	325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	BMP8B	P34820	402 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	NOV	P48745	357 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	ZNF536	O15090	1300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CNTNAP3-208	ENST00000469061	PLA2G6	O60733	806 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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