RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 ERO1BQ86YB8 467 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 PIGSQ96S52 555 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-209ENST00000465894 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 TRIM75PA6NK02 468 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ZBTB5O15062 677 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 MMP1P03956 469 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 STAT2P52630 851 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PPATQ06203 517 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 RESTQ13127 1097 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 MTMR2Q13614 643 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 MOB2Q70IA6 237 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FERMT3Q86UX7 667 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 HOMER1Q86YM7 354 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 MTMR8Q96EF0 704 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ELP3Q9H9T3 547 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CALML3P27482 149 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 NLRP5P59047 1200 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 C12orf42Q96LP6 360 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 BARHL2Q9NY43 387 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 STXBP3O00186 592 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CXCL11O14625 94 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 TRAF1Q13077 416 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GALNT17Q6IS24 598 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 BRAPQ7Z569 592 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 VCAM1P19320 739 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 KRT2P35908 639 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 HMGCS2P54868 508 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 NAPAP54920 295 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 KIFC2Q96AC6 838 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 BTBD18B2RXH4 712 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 GNA11P29992 359 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PPIL2Q13356 520 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ATL3Q6DD88 541 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FBXO11Q86XK2 927 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 COA7Q96BR5 231 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 SHISA4Q96DD7 197 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 OTUD5Q96G74 571 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 C6orf50Q9HD87 102 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 OTOFQ9HC10 1997 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 ESYT2A0FGR8 921 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 SMCO2A6NFE2 343 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 FDX1P10109 184 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 KRT85P78386 507 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 BLIDQ8IZY5 108 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 OPTNQ96CV9 577 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-209ENST00000465894 AMNQ9BXJ7 453 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms