RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.68■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ANKS1AQ92625 1134 aa20.68■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 VPS16Q9H269 839 aa20.68■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 KCNJ18B7U540 433 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 KCNJ12Q14500 433 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT17Q6IS24 598 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB22O15209 634 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 KIF20AO95235 890 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM14Q14142 442 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TEX35Q5T0J7 233 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 GDAQ9Y2T3 454 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 UBA7P41226 1012 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 PRCPP42785 496 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 INF2Q27J81 1249 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 BARHL2Q9NY43 387 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.66■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 LDHCP07864 332 aa20.65■□□□□ 0.9
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SYNE4-204ENST00000465425 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 M0R2N6 131 aa20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.65■□□□□ 0.9
SYNE4-204ENST00000465425 H7C1D1 291 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RFC4P35249 363 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 STIM1Q13586 685 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA1Q92805 767 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 LAD1O00515 517 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CYTH3O43739 400 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 UBXN1Q04323 297 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 NGLY1Q96IV0 654 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf37Q96NL8 207 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 STXBP3O00186 592 aa20.63■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 MYL1P05976 194 aa20.63■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PPP4CP60510 307 aa20.63■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PIP4K2BP78356 416 aa20.63■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 NFIXQ14938 502 aa20.63■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.63■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PP2D1A8MPX8 630 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 FECHP22830 423 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 VPS72Q15906 364 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 KLRF2D3W0D1 207 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 KCNB1Q14721 858 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TERF2Q15554 542 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CERS3Q8IU89 383 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 ADSSL1Q8N142 457 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RABGGTAQ92696 567 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 EPC1Q9H2F5 836 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 RASA1P20936 1047 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 KRT9P35527 623 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 GRIK5Q16478 980 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CNBD1Q8NA66 436 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PLIN2Q99541 437 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0U1RQJ8 604 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.61■□□□□ 0.89
SYNE4-204ENST00000465425 PSMA7O14818 248 aa20.61■□□□□ 0.89
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