RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 KLRF2D3W0D1 207 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 GNAQP50148 359 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 STK3Q13188 491 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PFKFB2O60825 505 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 DSG3P32926 999 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 RTN1Q16799 776 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CPVLQ9H3G5 476 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.75■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 NID2Q14112 1375 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PLA2G6O60733 806 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 HERVK_113P62684 666 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 ME3Q16798 604 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 RNF186Q9NXI6 227 aa22.74■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 TRPA1O75762 1119 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 ATG4CQ96DT6 458 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.73■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CA12O43570 354 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 TMX3Q96JJ7 454 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 MYPNQ86TC9 1320 aa22.72■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CPLX1O14810 134 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CDC27P30260 824 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CRHR2Q13324 411 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 GTF3C6Q969F1 213 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CDKL5O76039 1030 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D8O95759 1140 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 VWA5AO00534 786 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 ZBED4O75132 1171 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 LARGE1O95461 756 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SMARCA1P28370 1054 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SNAP25P60880 206 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SCRN1Q12765 414 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF11Q86T75 865 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 TLR2O60603 784 aa22.69■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 NECAB1Q8N987 351 aa22.69■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CPA4Q9UI42 421 aa22.69■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.69■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 PEX10O60683 326 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 LBX2Q6XYB7 198 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 FDX1P10109 184 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC174Q6PII3 467 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 MB21D1Q8N884 522 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 WBP1LQ9NX94 342 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CYTH3O43739 400 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 PLS1Q14651 629 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CPXCR1Q8N123 301 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 BTBD7Q9P203 1132 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 HOMER1Q86YM7 354 aa22.66■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 JMYQ8N9B5 988 aa22.66■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms