RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP95Q96GE4 821 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM232C9JQI7 657 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TTLL1O95922 423 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 PGK1P00558 417 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 BMP3P12645 472 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 MX1P20591 662 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC41Q15345 812 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM60Q495X7 471 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF180Q86T96 592 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CRBNQ96SW2 442 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 FEM1BQ9UK73 627 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RIPK3Q9Y572 518 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPY2A6NKD2 308 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 PPARAQ07869 468 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM161BQ96MY7 647 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 INCENPQ9NQS7 918 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 STX8Q9UNK0 236 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 AKR1A1P14550 325 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 MCCP23508 829 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC1A4P43007 532 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 SNAP25P60880 206 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TLE2Q04725 743 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC174Q6PII3 467 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 KCTD1Q719H9 257 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 REPS2Q8NFH8 660 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 BADQ92934 168 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 MKL1Q969V6 931 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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SH3BP1-204ENST00000459646 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 ALAS1P13196 640 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 STAT2P52630 851 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC96Q2M329 555 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 RILPL2Q969X0 211 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 SPC25Q9HBM1 224 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXO40Q9UH90 709 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP1-204ENST00000459646 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 POTEB2H3BUK9 544 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 DLL1O00548 723 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 NMT2O60551 498 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHA2P01877 340 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 RAG1P15918 1043 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 ACVR2BQ13705 512 aa10.14□□□□□ -0.79
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SH3BP1-204ENST00000459646 KCNA10Q16322 511 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM160B2Q86V87 743 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 CHST13Q8NET6 341 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 EVI5LQ96CN4 794 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF24Q9UPV7 400 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 LTBP2Q14767 1821 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PQY0 241 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 CLTBP09497 229 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 FDX1P10109 184 aa10.13□□□□□ -0.79
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