RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	MBD4	O95243	580 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	CSF2RA	P15509	400 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	APBB1	O00213	710 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	RLBP1	P12271	317 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	C12orf60	Q5U649	245 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	DDX11	Q96FC9	970 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	ASB2	Q96Q27	587 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	ELP1	O95163	1332 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	ACR	P10323	421 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRA-208	ENST00000455631	MYO9B	Q13459	2157 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	USP17L12	C9JPN9	530 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	USP17L21	D6R901	530 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ASGR1	P07306	291 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC4A3	P48751	1232 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF365	Q70YC5	407 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	SPC25	Q9HBM1	224 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	MCM3AP	O60318	1980 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	IGFBP4	P22692	258 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ADD2	P35612	726 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CDK7	P50613	346 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	IL27	Q8NEV9	243 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	MSRA	Q9UJ68	235 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	RIPK3	Q9Y572	518 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	GBF1	Q92538	1859 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ARVCF	O00192	962 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ADCY6	O43306	1168 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ACVR2B	Q13705	512 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ADGRE1	Q14246	886 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	RAB30	Q15771	203 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CPXCR1	Q8N123	301 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	MYH7	P12883	1935 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	GJA9	P57773	515 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRA-208	ENST00000455631	CYP2C18	P33260	490 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CTR9	Q6PD62	1173 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	HERVK_113	Q902F9	699 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	IL23A	Q9NPF7	189 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CHGB	P05060	677 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	ARMCX2	Q7L311	632 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.87	■■■□□ 2.05

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