RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-215	ENST00000447232	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	PDE8A	O60658	829 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	ALAD	P13716	330 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GBF1	Q92538	1859 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CYP2B6	P20813	491 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	LPAR1	Q92633	364 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	USP6NL	Q92738	828 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GDF11	O95390	407 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	IL2RA	P01589	272 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CENPC	Q03188	943 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	FPGS	Q05932	587 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GJD3	Q8N144	294 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MYH3	P11055	1940 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232		H7C1W4	665 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CACNB3	P54284	484 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	KCTD2	Q14681	263 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73	2e-8	■□□□□ 9.3
PMS1-215	ENST00000447232	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TRIO	O75962	3097 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MSC	O60682	206 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CRK	P46108	304 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TCF15	Q12870	199 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	RAB30	Q15771	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CCL14	Q16627	93 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	DCX	O43602	365 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	F11	P03951	625 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CLTB	P09497	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	PTPRA	P18433	802 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	CTSW	P56202	376 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TLE2	Q04725	743 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PMS1-215	ENST00000447232	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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