RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 STMN3Q9NZ72 180 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 OCA2Q04671 838 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TTC39CQ8N584 583 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CENPTQ96BT3 561 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GPT2Q8TD30 523 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD8Q9NX08 183 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TLK1Q9UKI8 766 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 POTEB3A0JP26 581 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD14O00487 310 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 KRT6BP04259 564 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP6O43182 974 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 YEATS4O95619 227 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 BCRP11274 1271 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KRT6CP48668 564 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TNNI2P48788 182 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ZBED6P86452 979 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PDCLQ13371 301 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KANK1Q14678 1352 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NOTOA8MTQ0 251 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MX2P20592 715 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CEP85Q6P2H3 762 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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PTPRC-209ENST00000442510 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.439e-6■■■■■ 50.1
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PTPRC-209ENST00000442510 BDNFP23560 247 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GJA9P57773 515 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TFAP4Q01664 338 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LAMC2Q13753 1193 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf183Q5T699 404 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SDE2Q6IQ49 451 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ABCB6Q9NP58 842 aa6.12□□□□□ -1.43
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